Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ncapd3Q6ZQK0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ncapd3Q6ZQK0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms