Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Topbp1Q6ZQF0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Topbp1Q6ZQF0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Topbp1Q6ZQF0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Topbp1Q6ZQF0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Topbp1Q6ZQF0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Topbp1Q6ZQF0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Topbp1Q6ZQF0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Topbp1Q6ZQF0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Topbp1Q6ZQF0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Topbp1Q6ZQF0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Topbp1Q6ZQF0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Topbp1Q6ZQF0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Topbp1Q6ZQF0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Topbp1Q6ZQF0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Topbp1Q6ZQF0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Topbp1Q6ZQF0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Topbp1Q6ZQF0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Topbp1Q6ZQF0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Topbp1Q6ZQF0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Topbp1Q6ZQF0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Topbp1Q6ZQF0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Topbp1Q6ZQF0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Topbp1Q6ZQF0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Topbp1Q6ZQF0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Topbp1Q6ZQF0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Topbp1Q6ZQF0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Topbp1Q6ZQF0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Topbp1Q6ZQF0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Topbp1Q6ZQF0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Topbp1Q6ZQF0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Topbp1Q6ZQF0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Topbp1Q6ZQF0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Topbp1Q6ZQF0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Topbp1Q6ZQF0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Topbp1Q6ZQF0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Topbp1Q6ZQF0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Topbp1Q6ZQF0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms