Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp34Q6ZQ93 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp34Q6ZQ93 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp34Q6ZQ93 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp34Q6ZQ93 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp34Q6ZQ93 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp34Q6ZQ93 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp34Q6ZQ93 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp34Q6ZQ93 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp34Q6ZQ93 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp34Q6ZQ93 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp34Q6ZQ93 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp34Q6ZQ93 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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Usp34Q6ZQ93 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp34Q6ZQ93 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp34Q6ZQ93 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp34Q6ZQ93 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp34Q6ZQ93 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp34Q6ZQ93 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp34Q6ZQ93 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp34Q6ZQ93 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp34Q6ZQ93 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp34Q6ZQ93 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp34Q6ZQ93 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp34Q6ZQ93 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp34Q6ZQ93 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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Usp34Q6ZQ93 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp34Q6ZQ93 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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Usp34Q6ZQ93 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp34Q6ZQ93 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp34Q6ZQ93 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp34Q6ZQ93 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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Usp34Q6ZQ93 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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Usp34Q6ZQ93 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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Usp34Q6ZQ93 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp34Q6ZQ93 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp34Q6ZQ93 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp34Q6ZQ93 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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Usp34Q6ZQ93 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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Usp34Q6ZQ93 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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Usp34Q6ZQ93 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp34Q6ZQ93 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp34Q6ZQ93 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
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Usp34Q6ZQ93 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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Usp34Q6ZQ93 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp34Q6ZQ93 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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