Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
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Efr3bQ6ZQ18 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efr3bQ6ZQ18 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efr3bQ6ZQ18 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efr3bQ6ZQ18 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Efr3bQ6ZQ18 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
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Efr3bQ6ZQ18 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Efr3bQ6ZQ18 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Efr3bQ6ZQ18 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Efr3bQ6ZQ18 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Efr3bQ6ZQ18 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Efr3bQ6ZQ18 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efr3bQ6ZQ18 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Efr3bQ6ZQ18 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efr3bQ6ZQ18 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efr3bQ6ZQ18 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efr3bQ6ZQ18 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efr3bQ6ZQ18 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efr3bQ6ZQ18 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efr3bQ6ZQ18 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efr3bQ6ZQ18 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efr3bQ6ZQ18 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Efr3bQ6ZQ18 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Efr3bQ6ZQ18 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efr3bQ6ZQ18 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efr3bQ6ZQ18 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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