Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPY7

Kdm3b, Lysine-specific demethylase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm3bQ6ZPY7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Kdm3bQ6ZPY7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Kdm3bQ6ZPY7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Kdm3bQ6ZPY7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Kdm3bQ6ZPY7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdm3bQ6ZPY7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm3bQ6ZPY7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm3bQ6ZPY7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm3bQ6ZPY7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm3bQ6ZPY7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm3bQ6ZPY7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm3bQ6ZPY7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm3bQ6ZPY7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm3bQ6ZPY7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm3bQ6ZPY7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm3bQ6ZPY7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm3bQ6ZPY7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm3bQ6ZPY7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm3bQ6ZPY7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm3bQ6ZPY7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm3bQ6ZPY7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm3bQ6ZPY7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm3bQ6ZPY7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm3bQ6ZPY7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm3bQ6ZPY7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm3bQ6ZPY7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm3bQ6ZPY7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm3bQ6ZPY7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm3bQ6ZPY7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm3bQ6ZPY7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm3bQ6ZPY7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm3bQ6ZPY7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm3bQ6ZPY7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm3bQ6ZPY7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm3bQ6ZPY7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm3bQ6ZPY7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm3bQ6ZPY7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm3bQ6ZPY7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm3bQ6ZPY7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm3bQ6ZPY7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm3bQ6ZPY7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm3bQ6ZPY7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm3bQ6ZPY7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm3bQ6ZPY7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms