Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sarm1Q6PDS3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms