Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc36Q6PDM4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc36Q6PDM4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms