Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM2

Srsf1, Serine/arginine-rich splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf1Q6PDM2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Srsf1Q6PDM2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Srsf1Q6PDM2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Srsf1Q6PDM2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Srsf1Q6PDM2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Srsf1Q6PDM2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Srsf1Q6PDM2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Srsf1Q6PDM2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf1Q6PDM2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf1Q6PDM2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf1Q6PDM2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms