Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dtx4Q6PDK8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms