Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Trak1Q6PD31 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trak1Q6PD31 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms