Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAM0

Prkab2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab2Q6PAM0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Prkab2Q6PAM0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkab2Q6PAM0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms