Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slf2Q6P9P0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slf2Q6P9P0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slf2Q6P9P0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms