Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp2d40Q6P8N9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp2d40Q6P8N9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp2d40Q6P8N9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp2d40Q6P8N9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp2d40Q6P8N9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp2d40Q6P8N9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp2d40Q6P8N9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp2d40Q6P8N9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms