Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rrp12Q6P5B0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rrp12Q6P5B0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rrp12Q6P5B0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rrp12Q6P5B0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rrp12Q6P5B0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rrp12Q6P5B0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rrp12Q6P5B0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rrp12Q6P5B0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rrp12Q6P5B0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rrp12Q6P5B0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rrp12Q6P5B0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rrp12Q6P5B0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rrp12Q6P5B0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rrp12Q6P5B0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rrp12Q6P5B0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rrp12Q6P5B0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rrp12Q6P5B0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rrp12Q6P5B0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rrp12Q6P5B0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rrp12Q6P5B0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rrp12Q6P5B0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rrp12Q6P5B0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rrp12Q6P5B0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rrp12Q6P5B0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rrp12Q6P5B0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rrp12Q6P5B0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rrp12Q6P5B0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Rrp12Q6P5B0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rrp12Q6P5B0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rrp12Q6P5B0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rrp12Q6P5B0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rrp12Q6P5B0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rrp12Q6P5B0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rrp12Q6P5B0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rrp12Q6P5B0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms