Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg2aQ6P4T0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg2aQ6P4T0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms