Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Slx4Q6P1D7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Slx4Q6P1D7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Slx4Q6P1D7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Slx4Q6P1D7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Slx4Q6P1D7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slx4Q6P1D7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slx4Q6P1D7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slx4Q6P1D7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slx4Q6P1D7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slx4Q6P1D7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slx4Q6P1D7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slx4Q6P1D7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Slx4Q6P1D7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Slx4Q6P1D7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Slx4Q6P1D7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Slx4Q6P1D7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Slx4Q6P1D7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Slx4Q6P1D7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Slx4Q6P1D7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Slx4Q6P1D7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Slx4Q6P1D7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slx4Q6P1D7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slx4Q6P1D7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms