Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms