Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rprd2Q6NXI6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rprd2Q6NXI6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rprd2Q6NXI6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms