Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms