Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Smarca2Q6DIC0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Smarca2Q6DIC0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Smarca2Q6DIC0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Smarca2Q6DIC0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Smarca2Q6DIC0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Smarca2Q6DIC0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Smarca2Q6DIC0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Smarca2Q6DIC0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Smarca2Q6DIC0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Smarca2Q6DIC0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Smarca2Q6DIC0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Smarca2Q6DIC0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Smarca2Q6DIC0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Smarca2Q6DIC0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Smarca2Q6DIC0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Smarca2Q6DIC0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Smarca2Q6DIC0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Smarca2Q6DIC0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Smarca2Q6DIC0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Smarca2Q6DIC0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Smarca2Q6DIC0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Smarca2Q6DIC0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Smarca2Q6DIC0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Smarca2Q6DIC0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Smarca2Q6DIC0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Smarca2Q6DIC0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Smarca2Q6DIC0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Smarca2Q6DIC0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Smarca2Q6DIC0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Smarca2Q6DIC0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Smarca2Q6DIC0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
Smarca2Q6DIC0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
Smarca2Q6DIC0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Smarca2Q6DIC0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Smarca2Q6DIC0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Smarca2Q6DIC0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Smarca2Q6DIC0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Smarca2Q6DIC0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Smarca2Q6DIC0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Smarca2Q6DIC0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Smarca2Q6DIC0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Smarca2Q6DIC0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Smarca2Q6DIC0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Smarca2Q6DIC0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Smarca2Q6DIC0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Smarca2Q6DIC0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Smarca2Q6DIC0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Smarca2Q6DIC0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Smarca2Q6DIC0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Smarca2Q6DIC0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Smarca2Q6DIC0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Smarca2Q6DIC0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Smarca2Q6DIC0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Smarca2Q6DIC0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Smarca2Q6DIC0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Smarca2Q6DIC0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Smarca2Q6DIC0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Smarca2Q6DIC0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Smarca2Q6DIC0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Smarca2Q6DIC0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Smarca2Q6DIC0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Smarca2Q6DIC0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Smarca2Q6DIC0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Smarca2Q6DIC0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Smarca2Q6DIC0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Smarca2Q6DIC0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Smarca2Q6DIC0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Smarca2Q6DIC0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Smarca2Q6DIC0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Smarca2Q6DIC0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Smarca2Q6DIC0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Smarca2Q6DIC0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Smarca2Q6DIC0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Smarca2Q6DIC0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Smarca2Q6DIC0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
Smarca2Q6DIC0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Smarca2Q6DIC0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Smarca2Q6DIC0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Smarca2Q6DIC0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Smarca2Q6DIC0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Smarca2Q6DIC0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Smarca2Q6DIC0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Smarca2Q6DIC0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
Smarca2Q6DIC0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Smarca2Q6DIC0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Smarca2Q6DIC0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Smarca2Q6DIC0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Smarca2Q6DIC0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Smarca2Q6DIC0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Smarca2Q6DIC0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Smarca2Q6DIC0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Smarca2Q6DIC0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Smarca2Q6DIC0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Smarca2Q6DIC0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Smarca2Q6DIC0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Smarca2Q6DIC0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
Smarca2Q6DIC0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Smarca2Q6DIC0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Smarca2Q6DIC0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms