Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cep290Q6A078 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cep290Q6A078 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms