Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZU6

Thsd7a, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, mousemouse

Predictions only

Length 1,645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7aQ69ZU6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Thsd7aQ69ZU6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Thsd7aQ69ZU6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Thsd7aQ69ZU6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Thsd7aQ69ZU6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Thsd7aQ69ZU6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Thsd7aQ69ZU6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Thsd7aQ69ZU6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Thsd7aQ69ZU6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Thsd7aQ69ZU6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Thsd7aQ69ZU6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Thsd7aQ69ZU6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Thsd7aQ69ZU6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Thsd7aQ69ZU6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Thsd7aQ69ZU6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Thsd7aQ69ZU6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Thsd7aQ69ZU6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Thsd7aQ69ZU6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Thsd7aQ69ZU6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Thsd7aQ69ZU6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Thsd7aQ69ZU6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Thsd7aQ69ZU6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Thsd7aQ69ZU6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Thsd7aQ69ZU6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Thsd7aQ69ZU6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Thsd7aQ69ZU6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Thsd7aQ69ZU6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Thsd7aQ69ZU6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Thsd7aQ69ZU6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Thsd7aQ69ZU6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Thsd7aQ69ZU6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Thsd7aQ69ZU6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Thsd7aQ69ZU6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Thsd7aQ69ZU6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Thsd7aQ69ZU6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Thsd7aQ69ZU6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Thsd7aQ69ZU6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms