Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK0

Prex1, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prex1Q69ZK0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prex1Q69ZK0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prex1Q69ZK0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms