Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CltcQ68FD5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CltcQ68FD5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CltcQ68FD5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CltcQ68FD5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CltcQ68FD5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CltcQ68FD5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CltcQ68FD5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CltcQ68FD5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CltcQ68FD5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CltcQ68FD5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CltcQ68FD5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CltcQ68FD5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CltcQ68FD5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CltcQ68FD5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CltcQ68FD5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CltcQ68FD5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CltcQ68FD5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CltcQ68FD5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CltcQ68FD5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CltcQ68FD5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CltcQ68FD5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CltcQ68FD5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CltcQ68FD5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CltcQ68FD5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CltcQ68FD5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CltcQ68FD5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CltcQ68FD5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CltcQ68FD5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CltcQ68FD5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CltcQ68FD5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CltcQ68FD5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CltcQ68FD5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CltcQ68FD5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CltcQ68FD5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CltcQ68FD5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CltcQ68FD5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CltcQ68FD5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CltcQ68FD5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CltcQ68FD5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CltcQ68FD5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CltcQ68FD5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CltcQ68FD5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CltcQ68FD5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms