Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VclQ64727 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VclQ64727 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VclQ64727 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VclQ64727 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VclQ64727 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VclQ64727 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VclQ64727 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VclQ64727 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VclQ64727 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VclQ64727 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
VclQ64727 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VclQ64727 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VclQ64727 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VclQ64727 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VclQ64727 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VclQ64727 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VclQ64727 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VclQ64727 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VclQ64727 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VclQ64727 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VclQ64727 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VclQ64727 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VclQ64727 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
VclQ64727 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VclQ64727 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VclQ64727 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VclQ64727 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VclQ64727 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VclQ64727 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VclQ64727 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VclQ64727 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VclQ64727 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
VclQ64727 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
VclQ64727 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VclQ64727 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VclQ64727 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VclQ64727 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VclQ64727 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VclQ64727 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VclQ64727 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VclQ64727 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VclQ64727 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VclQ64727 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VclQ64727 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VclQ64727 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VclQ64727 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VclQ64727 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VclQ64727 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VclQ64727 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VclQ64727 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VclQ64727 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VclQ64727 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VclQ64727 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VclQ64727 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VclQ64727 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VclQ64727 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VclQ64727 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VclQ64727 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VclQ64727 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VclQ64727 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VclQ64727 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VclQ64727 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VclQ64727 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VclQ64727 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VclQ64727 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VclQ64727 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VclQ64727 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VclQ64727 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VclQ64727 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VclQ64727 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VclQ64727 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VclQ64727 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VclQ64727 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
VclQ64727 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VclQ64727 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VclQ64727 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VclQ64727 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VclQ64727 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VclQ64727 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VclQ64727 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
VclQ64727 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VclQ64727 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VclQ64727 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
VclQ64727 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VclQ64727 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VclQ64727 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VclQ64727 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VclQ64727 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VclQ64727 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VclQ64727 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VclQ64727 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VclQ64727 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VclQ64727 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
VclQ64727 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VclQ64727 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VclQ64727 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VclQ64727 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VclQ64727 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VclQ64727 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms