Protein–RNA interactions for Protein: Q62520

Zic2, Zinc finger protein ZIC 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic2Q62520 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zic2Q62520 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Zic2Q62520 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zic2Q62520 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zic2Q62520 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zic2Q62520 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zic2Q62520 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Zic2Q62520 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zic2Q62520 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zic2Q62520 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zic2Q62520 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zic2Q62520 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zic2Q62520 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zic2Q62520 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zic2Q62520 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zic2Q62520 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zic2Q62520 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zic2Q62520 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zic2Q62520 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zic2Q62520 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zic2Q62520 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zic2Q62520 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zic2Q62520 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zic2Q62520 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Zic2Q62520 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zic2Q62520 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms