Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf260Q62513 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms