Protein–RNA interactions for Protein: Q62193

Rpa2, Replication protein A 32 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa2Q62193 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpa2Q62193 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpa2Q62193 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpa2Q62193 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpa2Q62193 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpa2Q62193 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpa2Q62193 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpa2Q62193 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpa2Q62193 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpa2Q62193 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpa2Q62193 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpa2Q62193 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpa2Q62193 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpa2Q62193 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpa2Q62193 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpa2Q62193 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpa2Q62193 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpa2Q62193 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpa2Q62193 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpa2Q62193 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpa2Q62193 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpa2Q62193 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpa2Q62193 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpa2Q62193 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpa2Q62193 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpa2Q62193 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpa2Q62193 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms