Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SnrpaQ62189 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnrpaQ62189 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms