Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Trim27Q62158 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms