Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AcanQ61282 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AcanQ61282 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AcanQ61282 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
AcanQ61282 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
AcanQ61282 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AcanQ61282 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
AcanQ61282 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AcanQ61282 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
AcanQ61282 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AcanQ61282 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AcanQ61282 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
AcanQ61282 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
AcanQ61282 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms