Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Trpc6Q61143 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
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Trpc6Q61143 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Trpc6Q61143 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Trpc6Q61143 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Trpc6Q61143 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trpc6Q61143 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Trpc6Q61143 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trpc6Q61143 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trpc6Q61143 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trpc6Q61143 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trpc6Q61143 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Trpc6Q61143 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trpc6Q61143 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trpc6Q61143 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trpc6Q61143 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Trpc6Q61143 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Trpc6Q61143 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trpc6Q61143 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trpc6Q61143 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Trpc6Q61143 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trpc6Q61143 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trpc6Q61143 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Trpc6Q61143 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trpc6Q61143 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Trpc6Q61143 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Trpc6Q61143 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trpc6Q61143 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Trpc6Q61143 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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