Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms