Protein–RNA interactions for Protein: Q61033

Tmpo, Lamina-associated polypeptide 2, isoforms alpha/zeta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmpoQ61033 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TmpoQ61033 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TmpoQ61033 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms