Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Klf3Q60980 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf3Q60980 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms