Protein–RNA interactions for Protein: Q60961

Laptm4a, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Laptm4aQ60961 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Laptm4aQ60961 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Laptm4aQ60961 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms