Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkn2cQ60772 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms