Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atf3Q60765 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Atf3Q60765 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms