Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Utp20Q5XG71 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Utp20Q5XG71 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Utp20Q5XG71 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Utp20Q5XG71 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Utp20Q5XG71 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Utp20Q5XG71 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Utp20Q5XG71 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Utp20Q5XG71 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Utp20Q5XG71 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Utp20Q5XG71 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Utp20Q5XG71 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Utp20Q5XG71 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Utp20Q5XG71 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Utp20Q5XG71 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Utp20Q5XG71 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Utp20Q5XG71 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Utp20Q5XG71 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Utp20Q5XG71 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Utp20Q5XG71 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Utp20Q5XG71 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Utp20Q5XG71 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Utp20Q5XG71 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Utp20Q5XG71 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Utp20Q5XG71 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Utp20Q5XG71 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Utp20Q5XG71 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Utp20Q5XG71 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Utp20Q5XG71 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Utp20Q5XG71 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Utp20Q5XG71 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Utp20Q5XG71 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Utp20Q5XG71 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Utp20Q5XG71 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Utp20Q5XG71 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Utp20Q5XG71 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Utp20Q5XG71 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Utp20Q5XG71 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Utp20Q5XG71 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Utp20Q5XG71 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Utp20Q5XG71 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Utp20Q5XG71 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Utp20Q5XG71 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Utp20Q5XG71 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Utp20Q5XG71 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Utp20Q5XG71 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Utp20Q5XG71 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms