Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4H9

Ncoa4, Nuclear receptor coactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa4Q5U4H9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ncoa4Q5U4H9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ncoa4Q5U4H9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ncoa4Q5U4H9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ncoa4Q5U4H9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ncoa4Q5U4H9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ncoa4Q5U4H9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ncoa4Q5U4H9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ncoa4Q5U4H9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ncoa4Q5U4H9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ncoa4Q5U4H9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ncoa4Q5U4H9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ncoa4Q5U4H9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ncoa4Q5U4H9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ncoa4Q5U4H9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ncoa4Q5U4H9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ncoa4Q5U4H9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ncoa4Q5U4H9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ncoa4Q5U4H9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ncoa4Q5U4H9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ncoa4Q5U4H9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ncoa4Q5U4H9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ncoa4Q5U4H9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ncoa4Q5U4H9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ncoa4Q5U4H9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms