Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Scaf1Q5U4C3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scaf1Q5U4C3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms