Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim38Q5SZ99 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim38Q5SZ99 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim38Q5SZ99 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim38Q5SZ99 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim38Q5SZ99 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Trim38Q5SZ99 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim38Q5SZ99 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim38Q5SZ99 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim38Q5SZ99 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim38Q5SZ99 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Trim38Q5SZ99 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim38Q5SZ99 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Trim38Q5SZ99 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Trim38Q5SZ99 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Trim38Q5SZ99 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Trim38Q5SZ99 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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