Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brip1Q5SXJ3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brip1Q5SXJ3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brip1Q5SXJ3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms