Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWP3

Nacad, NAC-alpha domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NacadQ5SWP3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NacadQ5SWP3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NacadQ5SWP3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NacadQ5SWP3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NacadQ5SWP3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NacadQ5SWP3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NacadQ5SWP3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NacadQ5SWP3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NacadQ5SWP3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NacadQ5SWP3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NacadQ5SWP3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
NacadQ5SWP3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NacadQ5SWP3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NacadQ5SWP3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NacadQ5SWP3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NacadQ5SWP3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NacadQ5SWP3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NacadQ5SWP3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NacadQ5SWP3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NacadQ5SWP3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NacadQ5SWP3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NacadQ5SWP3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NacadQ5SWP3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NacadQ5SWP3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
NacadQ5SWP3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NacadQ5SWP3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NacadQ5SWP3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NacadQ5SWP3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NacadQ5SWP3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
NacadQ5SWP3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NacadQ5SWP3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
NacadQ5SWP3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NacadQ5SWP3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NacadQ5SWP3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NacadQ5SWP3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NacadQ5SWP3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NacadQ5SWP3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NacadQ5SWP3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
NacadQ5SWP3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NacadQ5SWP3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NacadQ5SWP3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NacadQ5SWP3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NacadQ5SWP3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NacadQ5SWP3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
NacadQ5SWP3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NacadQ5SWP3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
NacadQ5SWP3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NacadQ5SWP3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NacadQ5SWP3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NacadQ5SWP3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NacadQ5SWP3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NacadQ5SWP3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NacadQ5SWP3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NacadQ5SWP3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NacadQ5SWP3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NacadQ5SWP3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
NacadQ5SWP3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NacadQ5SWP3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NacadQ5SWP3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NacadQ5SWP3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NacadQ5SWP3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NacadQ5SWP3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NacadQ5SWP3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NacadQ5SWP3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NacadQ5SWP3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NacadQ5SWP3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NacadQ5SWP3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NacadQ5SWP3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NacadQ5SWP3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NacadQ5SWP3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NacadQ5SWP3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NacadQ5SWP3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NacadQ5SWP3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NacadQ5SWP3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NacadQ5SWP3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NacadQ5SWP3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NacadQ5SWP3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NacadQ5SWP3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NacadQ5SWP3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
NacadQ5SWP3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NacadQ5SWP3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NacadQ5SWP3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NacadQ5SWP3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NacadQ5SWP3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NacadQ5SWP3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NacadQ5SWP3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NacadQ5SWP3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NacadQ5SWP3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NacadQ5SWP3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NacadQ5SWP3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
NacadQ5SWP3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NacadQ5SWP3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NacadQ5SWP3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
NacadQ5SWP3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NacadQ5SWP3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NacadQ5SWP3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NacadQ5SWP3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NacadQ5SWP3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NacadQ5SWP3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NacadQ5SWP3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms