Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW75

Ssh2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh2Q5SW75 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ssh2Q5SW75 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ssh2Q5SW75 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ssh2Q5SW75 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ssh2Q5SW75 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ssh2Q5SW75 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ssh2Q5SW75 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ssh2Q5SW75 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ssh2Q5SW75 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ssh2Q5SW75 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ssh2Q5SW75 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ssh2Q5SW75 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ssh2Q5SW75 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ssh2Q5SW75 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ssh2Q5SW75 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ssh2Q5SW75 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ssh2Q5SW75 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ssh2Q5SW75 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ssh2Q5SW75 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ssh2Q5SW75 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ssh2Q5SW75 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ssh2Q5SW75 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ssh2Q5SW75 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ssh2Q5SW75 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ssh2Q5SW75 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ssh2Q5SW75 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ssh2Q5SW75 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ssh2Q5SW75 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ssh2Q5SW75 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ssh2Q5SW75 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ssh2Q5SW75 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ssh2Q5SW75 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ssh2Q5SW75 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ssh2Q5SW75 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ssh2Q5SW75 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ssh2Q5SW75 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ssh2Q5SW75 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ssh2Q5SW75 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ssh2Q5SW75 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ssh2Q5SW75 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ssh2Q5SW75 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ssh2Q5SW75 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ssh2Q5SW75 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ssh2Q5SW75 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ssh2Q5SW75 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ssh2Q5SW75 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ssh2Q5SW75 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms