Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Psme4Q5SSW2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Psme4Q5SSW2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms