Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbm27Q5SFM8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbm27Q5SFM8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbm27Q5SFM8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbm27Q5SFM8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbm27Q5SFM8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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