Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms