Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rapgef6Q5NCJ1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rapgef6Q5NCJ1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms