Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Trappc1Q5NCF2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Trappc1Q5NCF2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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